Настоящий монастырь Эрден Зу был построен на остатках исторической столицы Великой Монгольской империи, Хархорумского города, переместив оставшиеся каменные стены на окраину Хархорума.

Во-первых, в 1580 году король Автай Саин вместе с младшим братом Тюменхеном Нойоном встретился с III Далай-ламой и попросил совета для их буддистской миссии в Монголии. И по совету III Далай-ламы они восстановили руины древнего Тахаиского храма города Хархорум и заложили фундамент монастыря Эрдена Зуу

С тех пор в 1586-1674 годах был построен храм Трое Зу и храм Ригсума Гомбо. Храм Охирдари, Храм Арвида, Великий Ступа и Большой Цогчин Дуган и Лаврин храмы были построены в 1701-1705 и 1771-1792, соответственно.

В период с 1802 по 1813 годы между ранее построенными стеновыми стенами было добавлено 56 дополнительных ступ. Это завершение стены забора финансировалось пожертвованиями аристократов, монахов, религиозного класса и преданных.

В настоящее время забор состоит из 108 ступ, окружающих монастырь, в то время как каждая сторона застенного заграждения длина 420 метров.

В 1782 году была создана школа Бодхи Саттвы с 50 студенческими монахами.

Поскольку монгольские аристократы и дворян считали честь иметь свой собственный Дуган или храм в своих стенах, многие храмы были недавно построены, такие как Тушет Хан Храм, Дуган Цвеенжава Нояна и Дуган Охирдар и т.д. К 1792 году он расширился до 62 храмов, 500 зданий и 10 000 монахов.

Сегодня осталось всего 18 храмов, в то время как три Зууского храма, Великий Ступа и Храм Серууна Лаврина являются единственными зданиями, оставленными из первоначального монастыря, включая каменные статуи и памятники, найденные из остатков города Хархорум.

Также есть Далай-лама, построенный в 1675 году, который был посвящен тогдашнему Далай-ламе Тибета. В этом храме представлены 13 фигур Махгальского божества, 6 реинкарнаций Далай-ламы и фигуры и портреты Инура Гегина Занабазара.

Две Хурденские храмы расположены с обеих сторон за пределами монастыря.

За этими храмами находятся две могилы, которые хранятся в кирпичном дворе. Одна из могил посвящена королю Автаю Сану, а другая – сыну короля Автаи Саину, Тусхету Хан Гомбодоржу.

За гробницами находятся Трое Зууских храмов. Эти здания были построены методом указания узлов на дерево без вставки одного ногтя. Во-первых, он используется для разделения горячего и холодного климата, а во-вторых, для поклонения.

В храмах и зданиях монастыря Эрдене Зу были украшены и, таким образом, хранят артефакты из Монголии XVII века, в том числе шедевры скульпторов, художников и кузнечников. Монастырь Эдене Зу сохранил ценное культурное наследие Монголии, такие как ручной рисунок, миниатюрное украшение, рисунок, гравировка, отливные скульптуры богов, ступа, ящики, курсовые горелки, керамика, колокол, ваджра, ганджир, хороль Мандала с драгоценными металлами, масками, танцами Цам и одежкой.